Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms