Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Limd1Q9QXD8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms