Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rai2Q9QVY8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms