Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms