Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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