Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace2Q9JL18 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace2Q9JL18 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms