Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms