Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms