Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms