Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc22Q9JIG7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc22Q9JIG7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc22Q9JIG7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc22Q9JIG7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms