Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn19Q9ET38 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn19Q9ET38 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn19Q9ET38 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn19Q9ET38 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn19Q9ET38 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn19Q9ET38 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn19Q9ET38 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn19Q9ET38 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn19Q9ET38 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn19Q9ET38 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn19Q9ET38 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn19Q9ET38 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn19Q9ET38 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn19Q9ET38 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn19Q9ET38 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms