Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
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Rb1cc1Q9ESK9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
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Rb1cc1Q9ESK9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
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Rb1cc1Q9ESK9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
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