Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DysfQ9ESD7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms