Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ush1cQ9ES64 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ush1cQ9ES64 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ush1cQ9ES64 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ush1cQ9ES64 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ush1cQ9ES64 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ush1cQ9ES64 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ush1cQ9ES64 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ush1cQ9ES64 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ush1cQ9ES64 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ush1cQ9ES64 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ush1cQ9ES64 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ush1cQ9ES64 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms