Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dap3Q9ER88 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms