Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RhojQ9ER71 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhojQ9ER71 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhojQ9ER71 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhojQ9ER71 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhojQ9ER71 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhojQ9ER71 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhojQ9ER71 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhojQ9ER71 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhojQ9ER71 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhojQ9ER71 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RhojQ9ER71 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhojQ9ER71 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhojQ9ER71 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms