Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms