Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms