Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms