Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms