Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms