Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms