Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Olfr434-201ENSMUST00000076752 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Tac1-203ENSMUST00000184986 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm12792-201ENSMUST00000117669 1019 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok3Q9DBU3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms