Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms