Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms