Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp8Q9DB85 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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