Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Pop5Q9DB28 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Pop5Q9DB28 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Pop5Q9DB28 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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