Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn3Q9DAW9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms