Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA04

Tmem89, Transmembrane protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem89Q9DA04 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem89Q9DA04 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms