Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N8

Pradc1, Protease-associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pradc1Q9D9N8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pradc1Q9D9N8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms