Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms