Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms