Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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