Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cldn23Q9D7D7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cldn23Q9D7D7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cldn23Q9D7D7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Cldn23Q9D7D7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Cldn23Q9D7D7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Cldn23Q9D7D7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Cldn23Q9D7D7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Cldn23Q9D7D7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn23Q9D7D7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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