Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms