Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms