Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms