Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm3404Q9D506 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm3404Q9D506 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm3404Q9D506 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm3404Q9D506 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm3404Q9D506 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm3404Q9D506 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm3404Q9D506 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3404Q9D506 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3404Q9D506 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3404Q9D506 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3404Q9D506 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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