Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms