Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms