Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D454 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D454 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D454 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D454 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D454 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D454 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D454 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D454 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D454 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D454 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D454 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D454 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D454 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms