Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms