Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Bcas2Q9D287 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bcas2Q9D287 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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