Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms