Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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