Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZQ6

Raet1e, Retinoic acid early-inducible protein 1-epsilon, mousemouse

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Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raet1eQ9CZQ6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Raet1eQ9CZQ6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Raet1eQ9CZQ6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Raet1eQ9CZQ6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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