Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.1 ms