Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis12Q9CY25 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms