Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl11Q9CXW4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms