Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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